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芒果源植物乳杆菌FMNP01的全基因组测序及序列分析

作者: 李雪飞 [1] 郭丽琼 [1] 叶志伟 [1] 刘英丽 [2] 林俊芳 [1]

关键词: 植物乳杆菌 全基因组测序 抗菌活性

摘要:目的:植物乳杆菌FMNP01是从新鲜热带芒果中分离获得的一株具有较好抗菌活性的乳酸菌.为深入研究其内在抗菌机理,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息.方法:采用高通量测序技术对植物乳杆菌FMNP01进行全基因组测序,采用生物信息学方法对其进行序列组装、基因预测与功能注释,并深入挖掘其细菌素合成相关基因簇信息.结果:通过基因组组装共得到18个重叠群,整个基因组大小为3 313 644 bp,GC含量44.48%.将序列提交至GenBank数据库,登陆号为JPSU00000000.在其基因组中发现一段细菌素合成相关基因簇.结论:本研究结果揭示了植物乳杆菌FMNP01抑菌机理,为其功能基因组学研究提供了理论依据.


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