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发酵辣椒细菌多样性的16S rDNA测序分析
作者: 韩俊燕 赵国忠 赵建新 张灏 陈卫
关键词: 发酵辣椒 细菌多样性 测序分析
摘要:以家庭自制的剁辣椒、酸辣椒、腌辣椒和辣椒酱为对象,研究不同样品中的微生物多样性,为分离其中的乳酸菌及开发发酵辣椒制品复合发酵剂提供参考依据.采用土壤基因组DNA提取试剂盒提取样品的基因组,然后PCR扩增细菌的16S rDNA V4区,琼脂糖凝胶电泳验证后回收胶,荧光定量后上机进行MiSeq高通量测序,然后分析样品中细菌的多样性.结果显示:不同样品所含细菌的种类多样性和丰度存在较大的差异.在属的水平上,剁辣椒中魏斯氏菌、明串珠菌和乳杆菌是主要的菌属,丰度在16%左右;乳杆菌(61.5%)和片球菌(28.6%)是酸辣椒中主要的细菌;腌辣椒中乳杆菌的丰度达到79.4%;辣椒酱的物种多样性最为丰富,魏斯氏菌(40.7%)和乳杆菌(11%)是其主要的微生物.
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