变形假单胞菌PtxS蛋白基因的克隆与分析

作者: 张晓飞 [1] 王大明 [2] 孙文敬 [3] 崔凤杰 [3] 李运哲 [1] 齐向辉 [1]

关键词: 变形假单胞菌 2-酮基葡萄糖酸 PtxS 克隆生物信息

摘要：为从变形假单胞菌中克隆2-酮基葡萄糖酸代谢调控蛋白PtxS的基因,并明确其基本的生物学信息,采用同源比对的方法设计引物,利用TD-PCR技术克隆PtxS的基因,再用生物信息学方法对其进行分析.试验结果表明:克隆的基因片段全长1 023 bp,其序列与铜绿假单胞菌、恶臭假单胞菌等假单胞菌的转录调控蛋白PtxS的基因序列一致性达80％左右,编码由340个氨基酸残基组成的蛋白PtxS.该蛋白与恶臭假单胞菌PtxS的同源性最高,氨基酸序列一致性达88％.该蛋白定位于细胞质,无信号肽和跨膜区,为亲水性蛋白.该蛋白的氨基酸序列中含有多个结构域,其二级结构中α螺旋、延伸链、β转角和无规卷曲所占的比例分别为54.41％,13.53％,10.88％和21.18％.本研究为该基因的表达及表达产物的分离纯化提供了理论基础.

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变形假单胞菌PtxS蛋白基因的克隆与分析

作者: 张晓飞 [1] 王大明 [2] 孙文敬 [3] 崔凤杰 [3] 李运哲 [1] 齐向辉 [1]

关键词: 变形假单胞菌 2-酮基葡萄糖酸 PtxS 克隆 生物信息

关键词: 变形假单胞菌 2-酮基葡萄糖酸 PtxS 克隆生物信息